Основной задачей отделения является составление и реализация индивидуальных реабилитационных медицинских программ для несовершеннолетних, оказание доврачебной помощи воспитанникам.

Основные направления деятельности отделения: 

1. Проведение первичного медицинского осмотра и первичной санитарной обработки несовершеннолетних.
2. Проведение диспансеризации несовершеннолетних.
3. Разработка индивидуальных программ медицинской реабилитации.
4. Оказание первой психологической помощи несовершеннолетним.
5. При наличии показаний — направление несовершеннолетних в стационарные медицинские учреждения.
6. Проведение сан.просвет. работы по профилактике наркомании, ВИЧ-инфекций, табакокурения среди несовершеннолетних.
7. Организация и проведение профилактических осмотров и профилактических прививок.
8. Систематический контроль за санитарным  состоянием и содержанием территории и всех помещений, соблюдением правил личной гигиены воспитанниками и персоналом.
9. Информирования руководителя учреждения ,воспитателей, педагогов по физическому и трудовому обучению о физическом состоянии здоровья детей, рекомендуемом режиме детей с отклонениями о состоянии здоровья.
10. Организация и проведение санитарно- противоэпидемиологических мероприятий.
11. Контроль за работой пищеблока и питанием детей.
12. Организация и контроль за проведением гигиенического воспитания и пропаганды здорового образа жизни среди несовершеннолетних.
13. Систематическое наблюдение за состоянием здоровья воспитанников, распределение детей на медицинские группы для занятий физическим воспитанием.
14. Организация и проведение химиопрофилактики воспитанникам по энторобиозу, «Виражу» туб.проб тубинфицированным.